影片繼續講述快樂、勇敢、熱愛和平的小摩爾們戰勝邪惡，保衛家園的故事。一個夢想成為大英雄的小男孩摩樂樂（喬詩語配音）居然發現驚天秘密，神秘的海妖寶藏將幾個孩子的命運聯系在一起，在一切的背后，來自邪惡魔法師庫拉（黃渤配音）的陰謀步步緊逼！幾隊人馬，海妖的寶藏是他們共同的目標，可是目的卻是各有不同，孩子們的夢想，RK（金鋒配音）的心結，庫拉的野心，忠于職守的瑞琪，穿越時空的友情與犧牲，所有的矛盾在海洋深處引爆，情節絲絲入扣，懸念迭起，我們摩爾小勇士們該何去何從……